Biostatisztika alkalmazása II. (GYTK1011biostalk2)
szabadon választható tantárgy gyógyszerész hallgatók számára
II. évfolyamtól, 2. félév
Kurzuskód: GYTK1011biostalk2
Előadó: Dr. Boda Krisztina tudományos főmunkatárs (koordinátor), Dr. Nyári Tibor tudományos munkatárs
Időterv: az oktatás II. évfolyamtól, második félévben történik. Óraszám: heti 2 óra
A tantárgy célja és specifikus célkitűzései
A tantárgy célja a biostatisztikai módszerek alkalmazásának ismertetése kutatási, kísérletes adatok illetve felmérések adatainak kiértékelésére, számítógépes statisztikai programrendszerek használata. biostatisztika leggyakrabban alkalmazott módszereinek ismertetése, alkalmazása és az eredmények interpretálása. A kurzus segítséget nyújthat tudományos diákköri munka, szakdolgozat illetve bármely kutató munka során keletkezett adatok szakszerű feldolgozásában, prezentálásában. A cél elsősorban a megfelelő módszer megtalálása, az adatok előkészítése, számítógépes futtatás és az eredmények értelmezése. Nem cél a matematikai statisztika elméletének részletezése, hanem a módszer elvi alapjainak, alkalmazhatóságának az ismertetése.
Évközi ellenőrzés módjai:
A félév során két alkalommal (6.-7. héten és az utolsó előtti héten) 1-1 órás dolgozatot kell írni. Javítási lehetőség: az utolsó héten az egész évi anyagból kell dolgozatot írni. Az első dolgozat maximum 40 pontos, a második dolgozat maximum 60 pontos, a két dolgozat összpontszáma maximum 100 pont lehet.
Számonkérés
A hallgatók az anyagból egy feladatsort kapnak a készüléshez, az elméleti részhez pedig konkrét kérdéseket. A dolgozatok alkalmával egy feladatlapot kell írásban kitölteni, amely elméleti és gyakorlati részből áll. A gyakorlati feladatok egy részét kézi kalkulátorral, másik részét számítógépes szoftverrel kell megoldani. Megengedett segédeszköz egy képletgyűjtemény, a hallgató által egy A4-es lapra felírt információ és a számítógépes rendszer futtatási utasítása. A félév végén a tantárgyat 5 fokozatú jeggyel értékeljük az alábbi táblázat szerint:
-
Teljesítmény
|
Minősítés
|
0 - 50 %
|
elégtelen (1)
|
51-62.5 %
|
elégséges (2)
|
63-75 %
|
közepes (3)
|
76 -91 %
|
jó (4)
|
92-100 %
|
jeles (5)
|
Az oktatás módszere
A számítógépes kabinetekben zajló órákon valamely statisztikai szoftver (SPSS vagy R) használatát tanulják meg a hallgatók. Az óra elején rövid elméleti áttekintést kapnak a hallgatók a módszerről és alkalmazásának feltételeiről, majd konkrét feladat megoldása következik a megfelelő program lefuttatásával és a program által kiírt eredményt értelmezésével. Emellett azonban kézi számolást is kell végezniük a hallgatóknak egyszerűbb esetekben, esetleg házi feladat formájában. A kézi számolás eredményét össze kell vetni a statisztikai program eredményével.
Részletes tematika
- Nemparaméteres módszerek. Rangszámok, kapcsolt rangok képzése.. Előjelpróba ill. előjeles rangpróba, Mann-Whitney U próba, Kruskal Wallis próba, Spearman f. rangkorreláció. A nemparaméteres próbák használatának előnyei és hátrányai, választás a paraméteres és nemparaméteres próba között.
- Áttekintés a variancia analízis egyéb eseteiről: két- és többszempontos variancia analízis, interakciók, ismételt méréses variancia analízis. Gyakorlás: GLM.
- Többváltozós módszerek I: többváltozós regresszió, diszkriminancia analízis rövid összefoglalása példákkal. Gyakorlás.
- Többváltozós módszerek II: faktor- cluster analízis példákkal. Gyakorlás: 3 dimenziós adatábrázolás.
- Epidemiológiai alapfogalmak. Bevezetés. Hányadosok -incidencia, prevalencia. 2x2-es kontingencia táblák I.: Szenzitivitás, specificitás, pozitív, negatív prediktív értékek, validitás.
- Deszkriptív és analitikus epidemiológiai módszerek I.: Eset-kontroll és kohorsz vizsgálatok 2x2-es kontingencia táblázatok II. : Esélyhányados, relatív kockázat.
- Deszkriptív és analitikus epidemiológiai módszerek II.: Chi-négyzet próba 2x2-es kontingencia táblázatok III. Konfidencia intervallum.
- Deszkriptív és analitikus epidemiológiai módszerek III.: Keresztmetszeti vizsgálatok. 2x2-es kontingencia táblázatok IV. Igazított esélyhányados. rxs kontingencia táblázatok
- Intervenciós epidemiológia. Randomizált "kettős-vak" kísérletek tervezése feldolgozása.
- Epidemiológiai tanulmányok tervezése. Minta elemszámának meghatározása. Feldolgozás, adatelemzés I.
- Epidemiológiai tanulmányok feldolgozása, adatelemzése II: logisztikus regresszió.
- Epidemiológiai tanulmányok kiértékelése, prezentálása
Ajánlott jegyzetek, irodalom: kötelező irodalom nincs, az előadások diái és egy szöveges és kézirat letölthetők az intézet honlapjáról és a Coospace-ről.
Ajánlott irodalom:
- Reiczigel Jenő, Harnos Andrea, Solymosi Norbert: Biostatisztika nem statisztikusoknak. PARS Kft. Nagykovácsi, 2007. R kódok letölthetők: http://biostatkonyv.hu/
- Hajtman Béla: Bevezetés a biostatisztikába nem csak orvosoknak. Edge 2000 Kiadó, 2012.
- A. Naiman, R. Rosenfeld, G. Zirkel: Understanding Statistics. McGraw-Hill Book Company, 1983.
- M.J. Campbell, D. Machin: Medical Statistics. A Commonsense Approach. John Wiley & Sons Chichester-New York- Brisbane-Toronto-Singapore , 1993.
- D. G. Altman: Practical Statistics for Medical Research. Chapman & Hall London · Glasgow · Weinheim · New York · Tokyo · Melbourne · Madras, 1995.
Biostatisztika (GYTK541, GYTK542)
gyógyszerész hallgatók számára
I. évfolyam, 2. félév
Kreditérték: 2 kreditpont
Előadás: heti 1 óra Vizsgaforma: kollokvium ötfokozatú
Gyakorlat: heti 1 óra Vizsgaforma: aláírás
Kötelező irodalom: nincs, az előadások diái és egy szöveges és kézirat letölthetők a Coosppace-ről.
Ajánlott irodalom:
1. Hajtman Béla: A biometria alapjai. Egyetemi jegyzet, SOTE, Budapest, 1983.
2. Vargha András: Matematikai statisztika pszichológiai, nyelvészeti és biológiai alkalmazásokkal. Pólya Kiadó, 2000.
3. Dinya Elek: Biometria az orvosi gyakorlatban. Medicina Könyvkiadó Rt. Budapest, 2001.
4. Reiczigel Jenő, Harnos Andrea, Solymosi Norbert: Biostatisztika nem statisztikusoknak. PARS Kft. Nagykovácsi, 2007.
Tárgyfelvétel előfeltétele: a matematika tantárgy (GYTK 021, GYTK022) elvégzése
Tematika (előadások és a hozzá kapcsolódó gyakorlatok, szemináriumok)
Tantárgyi követelmény: az órák folyamatos látogatása kötelező, egy félév során maximum 3 alkalommal lehet hiányozni. A gyakorlatokon mindkét dolgozatot meg kell írni. A dolgozatírásnál kalkulátor, képletgyűjtemény és egy A4-es lapra kézzel írott információ használata megengedett.
A számonkérés módja: a gyakorlaton a félév során két dolgozatot kell írni, maximum 50-50 (összesen 100 pontért). A gyakorlat értékelése három fokozatú jeggyel történik: kiválóan megfelelt (95 felett), megfelelt (50-95), nem felelt meg (50 alatt). Javítási lehetőség: a két dolgozat újra írása, mely az eddigi pontszámot felülbírálja. A gyakorlat eredménye 1/3 részben, maximum 10 ponttal járul hozzá a vizsgajegyhez. A pontszámok megállapítása az alábbi táblázat alapján történik:
-
0–50 gyakorlati pont: 0 vizsgapont
-
51–54 gyakorlati pont: 5 vizsgapont
-
55-64 gyakorlati pont: 6 vizsgapont
-
65–74 gyakorlati pont: 7 vizsgapont
-
75–84 gyakorlati pont: 8 vizsgapont
-
85–94 gyakorlati pont: 9 vizsgapont
-
95–100 gyakorlati pont: 10 vizsgapont
Vizsga. A félév lezárása kollokviummal történik. A hallgatók a szemeszter végén számítógépes tesztvizsgát, kollokviumot tesznek. A vizsgára az ETR rendszerben kell jelentkezni. A megadott vizsganapokra való jelentkezések az ETR rendszerben automatikusan a vizsgát megelőzően 24 órával záródnak le. Ismételt vizsga letétele a Tanulmányi és Vizsgaszabályzat általános rendelkezései alapján történik. Utóvizsga héten csak ismételt vizsgára van lehetőség. A tesztvizsga során csak a képletgyűjtemény és hagyományos kézi számítógép használható. Meg nem engedett segédeszköz (mobiltelefon, fényképezőgép, stb.) alkalmazása esetén a vizsga automatikusan sikertelen és a gyakorlatról hozott pontszámok törlődnek.
A kollokviumon maximum 20 pont szerezhető, ebből legalább 10 pontot el kell érni a sikeres vizsgához. A tesztvizsgán legalább 10 pontot elérők esetén a vizsgapontszámhoz hozzáadjuk a gyakorlaton szerzett maximum 10 pontot. A végleges jegy megállapítása az alábbi táblázat szerint történik:
-
0–14 pont: elégtelen
-
15–18 pont: elégséges
-
19–21 pont: közepes
-
23–26 pont: jó
-
27–30 pont: jeles
Bónusz pont. A félév során 3, az előadónak beadandó házi feladat lesz egyenként 5-5-5 pontszámmal. A legalább 8 pontot elérők plusz 1 vizsgapontot kapnak.
A vizsgára való jelentkezés, vizsgahalasztás: az ETR rendszeren keresztül történik
Tematika
Hét
|
Előadás
|
Gyakorlat
|
1.
|
Adattípusok, diszkrét és folytonos eloszlás, jellemzők.
|
Kézzel: oszlopdiagram, hisztogram, átlag-szórás
|
2.
|
Valószínűség, feltételes valószínűség. Valószínűségi változó. Változók eloszlása, nevezetes diszkrét és folytonos eloszlások.
|
Egyszerű feladatok a valószínűségszámításra, diagnosztikus tesztek mérőszámainak számítása. Átlag-szórás diagram, box diagram a mintabeli jellemzők alapján, ezek összehasonlítása a hisztogrammal.
|
3.
|
Sűrűségfüggvény, normális eloszlás, a 68-95-99 „szabály”. Becslés, konf. intervallum, az átlag szórása.
|
Valószínűségek meghatározása a normális eloszlás táblázata alapján. Feladatok a normális eloszlásra.
|
4.
|
Konfidencia intervallum az átlagra ismeretlen szórás esetén, statisztikai szignifikancia
|
Konfidencia intervallum számítás kézzel. A t-táblázat használata. Egyszerű szignifikanciavizsgálat konfidencia-intervallum alapján.
|
5.
|
Hipotézisvizsgálat, egymintás t-próba konfidencia-intervallum, táblázat és p-érték alapján
|
Egymintás t-próba elvégzése kézzel átlagból-szórásból. Géppel: páros t-próba.
|
6.
|
egymintás t-próba és páros t-próba.
|
Dolgozat: 1 kézi, 1 gépi, vagy 2 kézi, de legyen benne SPSS eredmény értékelése.
|
7.
|
Hipotézisvizsgálat általában, egy-és kétoldalú próbák, hibák, erő, kétmintás t-próba
|
Kézzel: Varianciák összehasonlítása, kétmintás t-próba eredményének értelmezése elvégzett számítás alapján.
|
8.
|
Varianciaanalízis
|
kétmintás t és One-Way ANOVA
|
9.
|
Korreláció, regresszió, transzformációk
|
Korreláció „szemmel” – http://www.ruf.rice.edu/~lane/stat_sim/reg_by_eye/ Korreláció-regresszió géppel.
|
10.
|
Gyakorisági táblázatok, chi-négyzet próba
|
Khi2 próba kézzel és géppel. File: GY7.doc
|
11.
|
Rangsorololáson alapuló próbák
|
Gyakorlás.
|
12.
|
Diagnosztikus tesztek és mérőszámaik 2x2-es táblázatok alapján
|
Gyakorlás.
|
13.
|
Esettanulmányok
|
Dolgozat: 1 kézi, 1 gépi
|
14.
|
Összefoglalás
|
Javítás
|
Biostatisztika
kötelező kurzus
A KURZUS ADATAI
Kurzus címe: Biostatisztika
Tanév/félév: 2019/2020. tanév II. félév
Kreditérték: 3 kreditpont
Előadás: heti 1 óra (GYTKm541), vizsgaforma: kollokvium
Gyakorlat/szeminárium: heti 1 óra (GYTKm542), vizsgaforma: aláírás
A KURZUS CÉLJA
A kurzus célja, hogy a hallgató megismerje és képes legyen alkalmazni a klinikai és kutató gyógyszerészi területen leggyakrabban használt statisztikai ismereteket, egy statisztikai program vagy egy orvosi cikk statisztikai eredményeit tudja értelmezni.
A kurzus elvégzése során a hallgatók megtanulják az adat, adatbázis fogalmát. Képesek lesznek megfogalmazni az adott kísérleti elrendezéshez tartozó hipotéziseket, elkészíteni a szükséges adatbázist, meghatározni az adatbázisban szereplő változók típusait, illetve jellemezni azok mintabeli eloszlását.
A hallgatók megismerik a orvosi kutatás során leggyakrabban használt hipotézisvizsgálatok módszereit, megtanulják kiválasztani a hipotézisek teszteléséhez megfelelő statisztikai módszereket, lefuttatni statisztikai program segítségével. Az eredmények ismeretében képesek lesznek megfelelő statisztikai és gyógyszerészeti következtetéseket levonni, illetve azokat a szakma elvárásainak megfelelően értelmezni. El tudják dönteni, mikor szükséges statisztikus segítségét kérni.
Előfeltételek (a tantárgy céljainak és követelményeinek eléréséhez szükséges, előzetesen elvárt tanulási eredmények vagy teljesített tantárgy): a matematika GYTK021, GYTK022) tárgyak sikeres teljesítése.
TÉMAKÖRÖK
- Adattípusok, jellemzési és ábrázolási módjaik (folytonos és diszkrét változók definíciói; abszolút és relatív gyakoriság, oszlopdiagram, kördiagram; átlag, medián, módusz, terjedelem, kvartilisek, szórás, variancia, hisztogram, doboz-ábra, átlag-szórás diagram)
- Valószínűségszámítási alapok I (alap definíció, odds fogalma). Statisztikai becslések: pont- és intervallumbecslés. A konfidencia-intervallum fogalma. Esélyhányados és 95%-os konfidenciaintervallum számítása.
- Valószínűségszámítási alapok II. (feltételes valószínűség) Gyakorisági táblázatok, 2x2-es táblázatok, diagnosztikai tesztek és mérőszámaik. Diszkrét valószínűségi változó és eloszlása, várható érték és variancia.
- Nevezetes eloszlások. Diszkrét: binomiális eloszlás. Folytonos eloszlások, a normális eloszlás. Standardizálás, binomiális teszt változó képlete mint a standardizálás alkalmazása.
- Centrális határeloszlás tétel, az átlag szórása. Konfidencia-intervallum a populáció-átlagra. A Student-féle t-eloszlás.
- Hipotézisvizsgálatok: egymintás t-próba, binomiális teszt
- t-próbák (egy-mintás, páros és kétmintás t-próbák)
- Statisztikai hibák, egy-és kétoldalas próbák, egyszempontos ANOVA
- Korrelációs és regressziós modellek, regressziók transzformációkkal. Hipotézisvizsgálatok a korrelációra és a regressziós együtthatókra.
- Két diszkrét változó függetlenségének vizsgálata (Khi-négyzet próba, Fisher egzakt teszt)
- Nem-paraméteres módszerek (Wilcoxon-féle rank próba, Mann-Whitney teszt, Kruskal-Wallis próba, rangkorreláció)
- Epidemiológia: 2x2-es táblázatok, esélyhányados, relatív kockázat, hipotézisvizsgálatok az esélyhányadosra és a relatív kockázatra. Egyezés mérése kappa statisztikával.
- Túlélés elemzés: halandósági táblák, Kaplan-Meier módszer.
- Összefoglalás
A TANTÁRGY TELJESÍTÉSÉNEK FELTÉTELEI
A vizsgára jelentkezés előfeltétele a gyakorlat teljesítése
Félév végi vizsga (kollokvium):
- Coospaces teszt a teljes félév elméleti és gyakorlati anyagából (statisztikai program használata nem szerepel a tesztkérdések között). A vizsgára a Neptun rendszerben kell jelentkezni. A megadott vizsganapokra való jelentkezések a Neptun rendszerben automatikusan a vizsgát megelőzően 24 órával záródnak le. Ismételt vizsga letétele a Tanulmányi és Vizsgaszabályzat általános rendelkezései alapján történik. Utóvizsgahéten csak ismételt vizsgára van lehetőség.
- A vizsgára jelentkezés előfeltétele a gyakorlat teljesítése
- A kollokvium eredménye a következő részekből tevődik össze:
1. Gyakorlaton szerzett pontok átszámítása vizsgaponttá:
Gyakorlati pont |
Vizsgapont |
0-50 |
Nem teljesített gyakorlat, nem vehető fel a vizsga. Ha valaki mégis felveszi a vizsgát, akkor annak az eredménye a vizsgateszt eredményétől függetlenül elégtelen (1)! |
51-54 |
5 |
55-64 |
6 |
65-74 |
7 |
75-84 |
8 |
85-94 |
9 |
95- |
10 |
2. A vizsgateszten elért pontszám:
Vizsgateszt eredménye (pont) |
0-9 |
Nem teljesített vizsga; elégtelen (1) vizsgajegy. |
10-20 |
Teljesített vizsga |
3. Amennyiben a hallgató mind a gyakorlati, mind a vizsgarészt teljesítette, a két pontszámot és a következő táblázat alapján alakul ki a végleges jegy:
Összesített pontszám |
Jegy |
0-14 |
Elégtelen (1) |
15-18 |
Elégséges (2) |
19-22 |
Közepes (3) |
23-26 |
Jó (4) |
27- |
Jeles (5) |
Kötelező irodalom:
- Coospacere feltöltött segédanyagok (előadás prezentációk, kiegészítő jegyzetek, R scriptek)
Ajánlott irodalom:
- Reiczigel Jenő – Harnos Andrea – Solymosi Norbert: Biostatisztika nem statisztikusoknak (2014). Pars Kft. ISBN: 978-963-06-3736-7
- Michael J. Campell – David Machin – Stephen J. Walters: Medical Statistics : A Textbook for the Health Sciences (2012) ISBN: 978-1-118-30061-9
- E-learning tananyagok: http://eta.bibl.u-szeged.hu/view/creators/Sz==0171cs=3AM=F3nika=3A=3A.html
- Angol nyelvű tananyagok, videók:
Biostatisztika
2020/2021 II. félév
kötelező kurzus
Kurzus címe: Biostatisztika
ELŐADÁS: hetente 1 óra; Hétfő 12:00 - 13:00 online YouTube-stream formájában
• Kreditérték: 3
• Kódja: GYTKm541
• Vizsgaforma: kollokvium
• Az előadás TEA tantárgyleírása PDF formátumban
GYAKORLAT: hetente 1 óra - MS Teams csatornáin a Neptunban megadott időpontokban; kontakt oktatásra való áttérés esetén a Semmelweis kollégium tantermében.
• Kreditérték: 0
• Kódja: GYTKm542
• Értékelés: aláírás
• A gyakorlat TEA tantárgyleírása PDF formátumban
A KURZUS CÉLJA
A kurzus célja, hogy a hallgató megismerje és képes legyen alkalmazni a klinikai és kutató gyógyszerészi területen leggyakrabban használt statisztikai ismereteket, egy statisztikai program vagy egy orvosi cikk statisztikai eredményeit tudja értelmezni.
A kurzus elvégzése során a hallgatók megtanulják az adat, adatbázis fogalmát. Képesek lesznek megfogalmazni az adott kísérleti elrendezéshez tartozó hipotéziseket, elkészíteni a szükséges adatbázist, meghatározni az adatbázisban szereplő változók típusait, illetve jellemezni azok mintabeli eloszlását.
A hallgatók megismerik a gyógyszerészeti kutatás során leggyakrabban használt hipotézisvizsgálatok módszereit, megtanulják kiválasztani a hipotézisek teszteléséhez megfelelő statisztikai módszereket, lefuttatni statisztikai program segítségével. Az eredmények ismeretében képesek lesznek megfelelő statisztikai és gyógyszerészeti következtetéseket levonni, illetve azokat a szakma elvárásainak megfelelően értelmezni. El tudják dönteni, mikor szükséges statisztikus segítségét kérni.
A KURZUS TELJESÍTÉSÉNEK FELTÉTELEI
GYAKORLAT
Hiányzások: A gyakorlatokon való részvétel kötelező; maximum 3 hiányzás megengedett!
Félévközi számonkérés:
A gyakorlaton a félév során két zárthelyi dolgozatot kell írni, összesen 100 gyakorlati pontért Mindkét dolgozat két részből fog állni:
- elméleti teszt (5 - 5%)
- gyakorlati teszt (45 - 45%)
Mind a kisdolgozatok, mind a zárthelyi dolgozatok Coospaces tesztek lesznek.
Pótlási, javítási lehetőségek:
- A gyakorlatok nem pótolhatók, minden hallgató az általa a Neptunban felvett gyakorlatra köteles bejárni
- Zárthelyi dolgozatok közül az egyik javításárára vagy pótlására az utolsó szorgalmi héten lehetséges Minden esetben a megismételt dolgozat pontszáma fog beszámítani a jegybe. A jegy az elért pontszám százaléka szerint:
Félév végi értékelés:
A gyakorlaton szerzett pontok alapján a gyakorlat értékelése
Gyakorlati pont Értékelés
- 0-50,99 Nem teljesített gyakorlat, nem vehető fel a vizsga Ha valaki mégis felveszi a vizsgát, akkor annak az eredménye a vizsgateszt eredményétől függetlenül elégtelen (1)!
- 51-100 aláírás
ELŐADÁS
Félév végi vizsga (kollokvium):
A vizsgára jelentkezés előfeltétele a gyakorlat teljesítése.
A félév végi ötfokozatú értékeléssel zárul. Az eredmény két részből tevődik össze:
- A gyakorlati dolgozatok vizsgapontokká átszámolt pontjai
- Félévi vizsga eredménye
Gyakorlaton szerzett pontok átszámítása vizsgaponttá:
Gyakorlati pont Vizsgapont
- 0-50,99 Nem teljesített gyakorlat, nem vehető fel a vizsga.
- 51-54,99 5
- 55-64,99 6
- 65-74,99 7
- 75-84,99 8
- 85-94,99 9
- 95- 100 10
Félév végi vizsga - Coospace teszt
Coospaces teszt a teljes félév elméleti és gyakorlati anyagából A vizsgára a Neptun rendszerben kell jelentkezni. A megadott vizsganapokra való jelentkezések a Neptun rendszerben automatikusan a vizsgát megelőzően 24 órával záródnak le. Ismételt vizsga letétele a Tanulmányi és Vizsgaszabályzat általános rendelkezései alapján történik. Utóvizsgahéten csak ismételt vizsgára van lehetőség.
A vizsgateszten maximum 20 pont szerezhető
Vizsgateszt pontszáma
- 0-9 Nem teljesített vizsga; elégtelen (1) vizsgajegy.
- 10-20 Teljesített vizsga
Vizsgajegy
Amennyiben a hallgató mind a gyakorlati, mind a vizsgarészt teljesítette, a két pontszámot összeadjuk, és a következő táblázat alapján alakul ki a végleges jegy:
Összesített pontszám Jegy
- 0 - 14,99 Elégtelen (1)
- 15 - 18,99 Elégséges (2)
- 19 - 22,99 Közepes (3)
- 23 - 26,99 Jó (4)
- 27 - Jeles (5)
TÉMAKÖRÖK
- Adattípusok, jellemzési és ábrázolási módjaik (folytonos és diszkrét változók definíciói; abszolút és relatív gyakoriság, oszlopdiagram, kördiagram; átlag, medián, módusz, terjedelem, kvartilisek, szórás, variancia, hisztogram, doboz-ábra, átlag-szórás diagram)
- Valószínűségszámítási alapok I (alap definíció, odds fogalma). Statisztikai becslések: pont- és intervallumbecslés. A konfidencia-intervallum fogalma. Esélyhányados és 95%-os konfidenciaintervallum számítása.
- Valószínűségszámítási alapok II. (feltételes valószínűség) Gyakorisági táblázatok, 2x2-es táblázatok, diagnosztikai tesztek és mérőszámaik. Diszkrét valószínűségi változó és eloszlása, várható érték és variancia.
- Nevezetes eloszlások. Diszkrét: binomiális eloszlás. Folytonos eloszlások, a normális eloszlás. Standardizálás, binomiális teszt változó képlete mint a standardizálás alkalmazása.
- Centrális határeloszlás tétel, az átlag szórása. Konfidencia-intervallum a populáció-átlagra. A Student-féle t-eloszlás.
- Hipotézisvizsgálatok: egymintás t-próba, binomiális teszt
- t-próbák (egy-mintás, páros és kétmintás t-próbák)
- Statisztikai hibák, egy-és kétoldalas próbák, egyszempontos ANOVA
- Korrelációs és regressziós modellek, regressziók transzformációkkal. Hipotézisvizsgálatok a korrelációra és a regressziós együtthatókra.
- Két diszkrét változó függetlenségének vizsgálata (Khi-négyzet próba, Fisher egzakt teszt)
- Nem-paraméteres módszerek (Wilcoxon-féle rank próba, Mann-Whitney teszt, Kruskal-Wallis próba, rangkorreláció)
- Epidemiológia: 2x2-es táblázatok, esélyhányados, relatív kockázat, hipotézisvizsgálatok az esélyhányadosra és a relatív kockázatra. Egyezés mérése kappa statisztikával.
- Túlélés elemzés: halandósági táblák, Kaplan-Meier módszer.
KÖTELEZŐ IRODALOM
- Az előadások óravázlatai. Letölthetők a Coospace-ről.
- Szűcs, Mónika; Rárosi, Ferenc; Griechisch, Erika: 0. Bevezetés a biostatisztikába és az R program használatába I. : bevezetés az R, RStudio használatába. (EFOP-3.4.3-16-2016-00014)
- Szűcs, Mónika; Griechisch, Erika; Rárosi, Ferenc: 1. Bevezetés a biostatisztikába és az R program használatába I. : változók jellemzése : a minta eloszlása. (EFOP-3.4.3-16-2016-00014)
- Szűcs, Mónika; Griechisch, Erika; Rárosi, Ferenc: 2. Bevezetés a biostatisztikába és az R program használatába I. : valószínűség, feltételes valószínűség, diagnosztikus tesztek. (EFOP-3.4.3-16-2016-00014)
- Szűcs, Mónika; Griechisch, Erika; Rárosi, Ferenc: 3. Bevezetés a biostatiszt.ikába és az R program használatába I. : a populáció eloszlása : elméleti eloszlások. (EFOP-3.4.3-16-2016-00014)
- Szűcs, Mónika; Griechisch, Erika; Rárosi, Ferenc: 4. Bevezetés a biostatisztikába és az R program használatába I. : statisztikai becslések, konfidencia intervallum. (EFOP-3.4.3-16-2016-00014)
- Szűcs, Mónika; Griechisch, Erika; Rárosi, Ferenc: 5. Bevezetés a biostatisztikába és az R program használatába I. : Hipotézisvizsgálatokról általánosan - első és másodfajta hiba. (EFOP-3.4.3-16-2016-00014)
- Szűcs, Mónika; Rárosi, Ferenc; Griechisch, Erika: 6. Bevezetés a biostatisztikába és az R program használatába I. : T-próbák. (EFOP-3.4.3-16-2016-00014)
- Szűcs, Mónika; Griechisch, Erika; Rárosi, Ferenc: 7. Bevezetés a biostatisztikába és az R program használatába I. : Korrelációszámítás. (EFOP-3.4.3-16-2016-00014)
- Szűcs, Mónika; Rárosi, Ferenc; Griechisch, Erika: 8. Bevezetés a biostatisztikába és az R program használatába I. : Regressziószámítás - Lineáris regresszió. (EFOP-3.4.3-16-2016-00014)
- Szűcs, Mónika; Griechisch, Erika; Rárosi, Ferenc: 9. Bevezetés a biostatisztikába és az R program használatába I. : Khi-négyzet próba függetlenségvizsgálatra. (EFOP-3.4.3-16-2016-00014)
AJÁNLOTT IRODALOM
- Reiczigel Jenő, Harnos Andrea, Solymosi Norbert: Biostatisztika nem statisztikusoknak. PARS Kft. Nagykovácsi, 2007. R kódok letölthetők: http://biostatkonyv.hu/
- Vargha András: Matematikai statisztika pszichológiai, nyelvészeti és biológiai alkalmazásokkal. Pólya Kiadó, 2000.
- Dinya Elek: Biometria az orvosi gyakorlatban. Medicina Könyvkiadó Rt. Budapest, 2001.
- Douglas G- Altman: Practical statistics for medical research. Chapman & Hall, 1995.
- Khan Academy: https://www.khanacademy.org/math/statistics-probability Crash Course (Statistics): https://www.youtube.com/playlist?list=PL8dPuuaLjXtNM_Y-bUAhblSAdWRnmBUcr